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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直到充当化工机械化学上的原料而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄窝囊废”成為“宝贝小分子式”的苦不堪言的过程相拟,一直到近十几种年才被出现其更重要的怪物学功能模块,自此“平躺农奴把声乐”,尤其是是在免疫细胞细菌感染性的重大疾病调查方向内独树一帜。就有几篇参考文献有关资料了在各项细菌感染性的重大疾病的爬行动物建模中分享衣康酸或其化学上的突显衍怪物的中药治疗益处,并出现其自身靶点。就衣康酸的“前世姻缘”与“今生今世”,具体情况见文章《乳酸的逆袭女神弟兄——衣康酸!本文陪你理解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化表达淀粉酶组学产品,实现1000+深奥度遮盖位点检测,固定复现原素靶点,全地方生信定性分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发觉”到“核实”全标准流程的服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验操作方法

02、实际参数

03、经“点”复现

在评测数据信息中,排除2个论文资料中新闻稿件的经典之作靶点名词解释衣康酸遮盖位点,如1个被察觉的衣康酸共价遮盖蛋清KEAP1,有着糖酵解通道中的3个至关重要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体根据蛋清NLRP3和体细胞挫裂时候中的至关重要蛋清RIPK3等,其质谱图方式图如图。

04、产品的优点和缺点

1.多方面质控

企业化非特异聊天检查器孵育、SDS-PAGE检查、WB核验、范例相关内容性了解等相互位检查,为了保证的项目结果显示正规性。

2.高安全性能质谱实验仪器软件

在Orbitrap Astral全第四代人高判别质谱仪金刚萨垛下,体现衣康碱化突显位点及蛋白质评定新深度1,帮助有效设计新察觉到。

3.全操作流程一走式服务的

为拜谱动物成熟的实验英文游戏平台,可可以提供“受损细胞培植→测试探针孵育→WB检查→玄之又玄度衣康酸性反应修饰语检查→属于生信浅析→独特位点PRM认可”全过程提供服务,省时保持平衡更先问。

05、定量分析信息(方面)

06、选用走向

PART 2、期刊论文手机分享

医学文献一

日文标题格式:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名字宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

研究探讨方式:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

英语怎么说标题格式:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

常常题目:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

科研内部:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例衍生产品工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13更具较少的底物组合技能,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康硝化作用装饰组实测值数据信息中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用体现(有以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

作为一个TCA不断循环中的两边产生物,衣康酸调结产生、免役和支原体感染两者之间的之间用途,为控制免役支原体感染性肠道问题供应了换用控制攻略。衣康酸成分中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸成分能对血清质上的可溶性半胱氨酸残基实施烷基化表达语(迈克尔暴伤化学反应),相应泰语翻译后表达语被被称作“衣康酸表达语(itaconation)”,从而干扰血清质系统,控制免役回应和产生方法,为多肠道问题口服药科研开发供应新指导思想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化呈现蛋白酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学肯定一定量靶向疗法细胞代谢组(QMT1000)或能量是什么排泄靶点排泄组商品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

决定性医学文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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